作为下一代测序(N.G.S.)目标富集和合成生物学领域的领导者,Arbor生物科学公司于1月14日宣布与国际小麦基因组测序联盟(I.W.G.S.C.)建立合作伙伴关系,国际小麦基因组测序联盟是一个致力于为中国春面包小麦品种开发金标准参考基因组的国际组织。

这些伙伴关系还将为I.W.G.S.C.成员提供标准化的外显子组研究和开发小组。

“自2005年以来,我们的成员一直在共同努力,为中国春天创造一个金标准的参考基因组,”国际w.g.s.c.执行董事凯莉·埃弗索尔(Kellye Eversole)说,“与Arbor生物科学公司的合作将加速对这一非常复杂的基因组内部运作的研究。”

国际w.g.s.c去年夏天宣布,它成功地对面包小麦的基因组进行了测序,这是一项了不起的成就,因为它的巨大尺寸(比人类基因组大5倍)和复杂性(面包小麦有三个亚基因组,超过85%的基因组是由重复元素组成的)。

I.W.G.S.C.说,只分析外显子组或功能表达基因的潜力,大大降低了每个样本测序的成本,加快了结果数据的分析速度。

Arbor Biosciences正在推出最初的myBaits在圣地亚哥举行的国际动植物基因组会议上,专家小麦外显子组捕获小组基于六倍体小麦中完整的高置信外显子注释基因组。与I.W.G.S.C.及其成员的合作关系将继续下去,因为Arbor计划开发外显子组面板的新迭代,以进一步了解基因组以及特定于疾病和抗旱性的面板。此外,Arbor Biosciences表示,他们正在开发一个强大的外显子组生物信息学管道,以简化数据分析并在整个联盟中提供一致性。

Arbor生物科学公司的资深科学家Jacob Enk博士说:“我们很自豪能够开发出这种小麦外显子组面板,它可以与I.W.G.S.C一起与任何库制剂配对。”“该小组将被添加到我们的定向测序服务中,为需要从DNA到数据分析的完整解决方案的研究人员提供服务。”

中国春的参考序列于2017年1月向科学界公开,并在该杂志上发表了对参考序列的分析科学2018年8月。自2018年初以来,使用这一资源发表了250多篇论文,但只有一部分基因组得到了人工或功能性的高可信度注释。

Arbor Biosciences和i.w.g.s.c表示,他们将继续与联盟成员、外部育种家、植物科学家和小麦种植者合作,进一步确定基因组,并开发研究这种宝贵作物的新资源。